El Programa JUNTOS tiene una presencia estratégica en los rincones más vulnerables del Perú, priorizando distritos rurales y urbano-marginales con altos índices de pobreza. Actualmente opera en 1,500 distritos de los 24 departamentos del país, con especial énfasis en las regiones andinas (como Huancavelica, donde cubre el 92% de distritos) y la Amazonía (Loreto, Ucayali). Lo que hace único a JUNTOS es su capacidad de llegar a comunidades indígenas quechua y aimara, poblaciones asháninkas en la selva central, y zonas altoandinas a más de 4,000 msnm, donde el Estado tradicionalmente tenía poca presencia. Según datos del MIDIS, el 68% de los hogares beneficiarios están en zonas rurales extremas, muchos accesibles solo por trocha o río. La cobertura se amplía cada año mediante brigadas móviles que recorren comunidades con tablets para inscribir familias, demostrando que ningún peruano está demasiado lejos para recibir oportunidades.